Mletačka vlast dodijelila je crkvu franjevcima trećeg reda. Crkva je popravljena, a samostan je proširen uz pomoć domicilnih ljudi u 16. stoljeću. Franjevci su živjeli u samostanu i svoje vrijeme posvetili prepisivanju vjerskih knjiga napisanih glagoljicom, kada nisu molili ili radili na zemlji. Samostan se sastoji od klaustra i bunara u središtu, koji datira iz 17. stoljeća. Muzej koji čuva zbirku crkvenih umjetnina i arheoloških eksponata iz okolice je smješten u franjevačkom samostanu Svete Marije Magdalene.
